MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 chromosome linear

Total Repeats: 41441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003063	TCG	2	6	55123	55128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891869
1002	NC_003063	TCC	2	6	55173	55178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891869
1003	NC_003063	GCA	2	6	55202	55207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891869
1004	NC_003063	CGG	2	6	55240	55245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891869
1005	NC_003063	CAGAT	2	10	55248	55257	40 %	20 %	20 %	20 %	15891869
1006	NC_003063	CGGA	2	8	55282	55289	25 %	0 %	50 %	25 %	15891869
1007	NC_003063	CAGC	2	8	55306	55313	25 %	0 %	25 %	50 %	15891869
1008	NC_003063	A	7	7	55350	55356	100 %	0 %	0 %	0 %	15891869
1009	NC_003063	TCC	2	6	55394	55399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891869
1010	NC_003063	CGG	2	6	55471	55476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891869
1011	NC_003063	AG	3	6	55501	55506	50 %	0 %	50 %	0 %	15891869
1012	NC_003063	AGC	2	6	55641	55646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891869
1013	NC_003063	CAGC	2	8	55670	55677	25 %	0 %	25 %	50 %	15891869
1014	NC_003063	AG	3	6	55732	55737	50 %	0 %	50 %	0 %	15891869
1015	NC_003063	GTCCG	2	10	55738	55747	0 %	20 %	40 %	40 %	15891869
1016	NC_003063	CCG	2	6	55816	55821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891869
1017	NC_003063	CAGC	2	8	55847	55854	25 %	0 %	25 %	50 %	15891869
1018	NC_003063	CAG	2	6	55889	55894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891869
1019	NC_003063	CGCGG	2	10	55943	55952	0 %	0 %	60 %	40 %	15891869
1020	NC_003063	ACG	2	6	55956	55961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891869
1021	NC_003063	CAAC	2	8	55986	55993	50 %	0 %	0 %	50 %	15891869
1022	NC_003063	GAA	2	6	56021	56026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891869
1023	NC_003063	GTC	2	6	56036	56041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891869
1024	NC_003063	GAC	2	6	56111	56116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891869
1025	NC_003063	CGC	2	6	56151	56156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891869
1026	NC_003063	G	6	6	56170	56175	0 %	0 %	100 %	0 %	15891869
1027	NC_003063	ATG	2	6	56196	56201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891869
1028	NC_003063	AGC	2	6	56235	56240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891869
1029	NC_003063	TTG	2	6	56244	56249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891869
1030	NC_003063	TGCC	2	8	56254	56261	0 %	25 %	25 %	50 %	15891869
1031	NC_003063	TTG	2	6	56271	56276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891869
1032	NC_003063	GT	3	6	56338	56343	0 %	50 %	50 %	0 %	15891869
1033	NC_003063	GCG	2	6	56388	56393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891869
1034	NC_003063	ATG	2	6	56394	56399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891869
1035	NC_003063	CGA	2	6	56449	56454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891869
1036	NC_003063	GCG	2	6	56455	56460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891869
1037	NC_003063	GAA	2	6	56524	56529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891869
1038	NC_003063	GCG	2	6	56620	56625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891869
1039	NC_003063	ATG	3	9	56676	56684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891869
1040	NC_003063	CAATCG	2	12	56746	56757	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15891869
1041	NC_003063	CGA	2	6	57091	57096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185587
1042	NC_003063	CTGC	2	8	57114	57121	0 %	25 %	25 %	50 %	159185587
1043	NC_003063	TTC	2	6	57149	57154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159185587
1044	NC_003063	GGA	2	6	57162	57167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159185587
1045	NC_003063	CCGA	2	8	57245	57252	25 %	0 %	25 %	50 %	159185587
1046	NC_003063	CCAT	2	8	57290	57297	25 %	25 %	0 %	50 %	159185587
1047	NC_003063	TC	3	6	57322	57327	0 %	50 %	0 %	50 %	159185587
1048	NC_003063	ACA	2	6	57491	57496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159185587
1049	NC_003063	CCCG	2	8	57549	57556	0 %	0 %	25 %	75 %	159185587
1050	NC_003063	CGT	2	6	57580	57585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185587
1051	NC_003063	CGG	2	6	57589	57594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185587
1052	NC_003063	CTG	2	6	57736	57741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185587
1053	NC_003063	CG	3	6	57788	57793	0 %	0 %	50 %	50 %	159185587
1054	NC_003063	TTG	2	6	57815	57820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159185587
1055	NC_003063	CGC	2	6	57832	57837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185587
1056	NC_003063	GTATC	2	10	57861	57870	20 %	40 %	20 %	20 %	159185587
1057	NC_003063	CGA	2	6	57909	57914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185587
1058	NC_003063	TTTG	2	8	57918	57925	0 %	75 %	25 %	0 %	159185587
1059	NC_003063	GCC	2	6	57977	57982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185587
1060	NC_003063	GCA	3	9	58011	58019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185587
1061	NC_003063	GCC	2	6	58022	58027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185587
1062	NC_003063	GCTG	2	8	58029	58036	0 %	25 %	50 %	25 %	159185587
1063	NC_003063	GTC	2	6	58054	58059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185587
1064	NC_003063	TTC	2	6	58091	58096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159185587
1065	NC_003063	GCC	2	6	58118	58123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185587
1066	NC_003063	TGG	2	6	58176	58181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159185587
1067	NC_003063	CGC	2	6	58212	58217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185587
1068	NC_003063	CGT	2	6	58225	58230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185587
1069	NC_003063	AAT	2	6	58237	58242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159185587
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1073	NC_003063	TGC	2	6	58877	58882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185588
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1081	NC_003063	CCT	2	6	59197	59202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159185588
1082	NC_003063	GGAG	2	8	59268	59275	25 %	0 %	75 %	0 %	159185588
1083	NC_003063	CGC	3	9	59325	59333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185588
1084	NC_003063	TTC	3	9	59374	59382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159185588
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1086	NC_003063	CGA	2	6	59454	59459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185588
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1088	NC_003063	CTGTC	2	10	59483	59492	0 %	40 %	20 %	40 %	159185588
1089	NC_003063	GATT	2	8	59558	59565	25 %	50 %	25 %	0 %	159185588
1090	NC_003063	CGG	3	9	59703	59711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185588
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1093	NC_003063	GTT	2	6	59902	59907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159185588
1094	NC_003063	TCA	2	6	59981	59986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159185588
1095	NC_003063	CGGA	2	8	60018	60025	25 %	0 %	50 %	25 %	159185588
1096	NC_003063	CG	3	6	60064	60069	0 %	0 %	50 %	50 %	159185588
1097	NC_003063	CGATGA	2	12	60071	60082	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159185588
1098	NC_003063	ACG	2	6	60140	60145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185588
1099	NC_003063	CATC	2	8	60159	60166	25 %	25 %	0 %	50 %	159185588
1100	NC_003063	CTC	2	6	60172	60177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159185588
1101	NC_003063	GCC	2	6	60283	60288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185588
1102	NC_003063	AGGA	2	8	60292	60299	50 %	0 %	50 %	0 %	159185588
1103	NC_003063	TACGTC	2	12	60305	60316	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159185588
1104	NC_003063	AG	3	6	60346	60351	50 %	0 %	50 %	0 %	159185588
1105	NC_003063	ACTG	2	8	60378	60385	25 %	25 %	25 %	25 %	159185588
1106	NC_003063	TTC	2	6	60880	60885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891866
1107	NC_003063	CAT	2	6	60898	60903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891866
1108	NC_003063	GAT	2	6	60952	60957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891866
1109	NC_003063	GC	3	6	60979	60984	0 %	0 %	50 %	50 %	15891866
1110	NC_003063	CCG	2	6	61007	61012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891866
1111	NC_003063	T	6	6	61047	61052	0 %	100 %	0 %	0 %	15891866
1112	NC_003063	GACC	2	8	61068	61075	25 %	0 %	25 %	50 %	15891866
1113	NC_003063	AGCGC	2	10	61082	61091	20 %	0 %	40 %	40 %	15891866
1114	NC_003063	CGG	2	6	61116	61121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891866
1115	NC_003063	ACAG	2	8	61132	61139	50 %	0 %	25 %	25 %	15891866
1116	NC_003063	CGA	2	6	61142	61147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891866
1117	NC_003063	CCGG	2	8	61154	61161	0 %	0 %	50 %	50 %	15891866
1118	NC_003063	AT	3	6	61163	61168	50 %	50 %	0 %	0 %	15891866
1119	NC_003063	GCA	2	6	61179	61184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891866
1120	NC_003063	CCCCA	2	10	61221	61230	20 %	0 %	0 %	80 %	15891866
1121	NC_003063	GCCGGA	2	12	61270	61281	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15891866
1122	NC_003063	CCA	2	6	61290	61295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15891866
1123	NC_003063	CT	4	8	61299	61306	0 %	50 %	0 %	50 %	15891866
1124	NC_003063	CGTC	2	8	61323	61330	0 %	25 %	25 %	50 %	15891866
1125	NC_003063	GAC	2	6	61336	61341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891866
1126	NC_003063	GCCGT	2	10	61343	61352	0 %	20 %	40 %	40 %	15891866
1127	NC_003063	CGC	2	6	61407	61412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891866
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1243	NC_003063	GTCA	2	8	67571	67578	25 %	25 %	25 %	25 %	15891862
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1247	NC_003063	T	6	6	67808	67813	0 %	100 %	0 %	0 %	15891861
1248	NC_003063	TTC	2	6	67829	67834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891861
1249	NC_003063	CGGC	2	8	67860	67867	0 %	0 %	50 %	50 %	15891861
1250	NC_003063	TCT	2	6	67870	67875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891861
1251	NC_003063	CGT	2	6	67879	67884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891861
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1253	NC_003063	TCTG	2	8	67954	67961	0 %	50 %	25 %	25 %	15891861
1254	NC_003063	CGG	3	9	68056	68064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891861
1255	NC_003063	TC	3	6	68134	68139	0 %	50 %	0 %	50 %	15891861
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1257	NC_003063	TTCCG	2	10	68179	68188	0 %	40 %	20 %	40 %	15891861
1258	NC_003063	CCCTG	2	10	68248	68257	0 %	20 %	20 %	60 %	15891861
1259	NC_003063	CGT	3	9	68263	68271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891861
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1377	NC_003063	AAAAT	2	10	73290	73299	80 %	20 %	0 %	0 %	159185590
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